明代，由于明朝直接控制的地区仅到哈密，所以新疆的屯田一度衰落。而到了清朝时期，新疆的屯田再度兴起，且超过了历史上的任何一个朝代。

清代新疆屯田大致可分为三个阶段：一是清朝统一新疆以前时期，主要是康(熙)雍(正)时期；二是清朝统一新疆以后的近百年间，主要包括乾(隆)、嘉(庆)、道(光)三朝；三是新疆建省前后，即光绪时期。

在第一阶段，由于清朝与准噶尔时战时和，为解决军队粮食供给问题，清朝开始在巴里坤、哈密、吐鲁番等地屯田。但此时屯田形式单一，规模较小，且仅限于新疆东部地区。

第二阶段可分为乾(隆)嘉(庆)和道光前、后两个时期。在前一时期，由于清朝统一新疆，屯田获得很大发展。屯田点遍及全疆，形式多种多样，不仅有兵屯(包括旗屯)，而且有民屯(户屯)、遣屯、回屯。

兵屯，即利用军队进行屯田生产。清朝统一新疆后，从内地调数万以汉族、回族为主的绿营军队，携带家眷集中在天山北部地区长期驻防。这些军队到新疆后，除少数用于其他事务外，大部分从事屯田。他们在原有军队建制的基础上，分布在东从巴里坤，西到伊犁、塔城的天山北部各主要地点，开荒种地，使大片万古荒原成为肥沃的良田。

民屯，即以汉族、回族农民为主进行的屯田生产。清朝统一新疆后，为了加速新疆地区的经济开发，制定了许多优惠政策，动员组织甜内地的农民到新疆屯田。对内地愿意到新疆屯田的农民，官府提供车辆和沿途生活费用，并派人护送到屯田目的地。农民群众到达屯区后，官府提供土地、农具、种子以及房屋、口粮等。农民垦种的土地，六年之内不纳税，收入全部归己；鼓励有能力的农民多垦种土地，这部分多垦种的土地也长期不收赋税。在清廷的大力鼓励支持下，内地，特别是靠近新疆的甘肃各州县的贫苦农民群众大批迁居北疆地区，开荒种地，很快成为新疆发展农业生产的一支重要力量。据有关资料统计，到嘉庆末年时,北疆在册民屯人口已达20万人以上，垦种土地至少在100万亩以上①。

回屯，即维吾尔族农民群众进行的屯田。清朝统一新疆后，从1760年到1768年，清朝官府从南疆各地共动员组织了6 300余户维吾尔农民到伊犁河两岸垦荒种地。在伊犁种地的维吾尔农民分设九屯，由各级伯克管理。嘉庆九年(1804年)，由于人口繁衍，又增设四屯。每户每年向官府交粮16.6石，每年共向官

府交粮10万石左右。维吾尔农民所进行的屯田不仅成为伊犁地区农业生产的主要力量，而且是这一地区国库粮食的主要来源。

遣屯，也称犯屯，即由内地发遣到新疆服刑的罪犯进行的屯田。1756年，清廷把内地重罪免死犯人首批发遣到哈密屯田。以后，又陆续将一些犯人发遣到巴里坤、乌鲁木齐、昌吉、玛纳斯、乌苏、精河、伊犁、塔城等地。每人给地12亩，另给种子、牛具，每年纳粮6石。携带家眷者，另给地5亩，自行垦种。这些屯田遣犯的生产活动一般由当地驻军直接监管，表现较好者可以在当地落户，成为在籍农户。在清代新疆屯田中，犯屯规模虽然比较小，人员流动性比较大，效果并不理想。但很多遣犯服役到期后多在新疆安家落户，后来成为新疆民屯的重要一部分。

旗屯，即由驻防新疆的八旗官兵进行的屯田。清朝统一新疆以后，把内地满、蒙古(察哈尔)、锡伯、索伦(达斡尔)等族八旗官兵移驻北疆携眷长期驻防。除满族官兵专事训练巡边外，其他各族官兵都要“自耕自食”或“自牧自食”。特别是锡伯族官兵在迁居新疆前，就曾长期从事过农业生产，迁居伊犁河南岸后，仍然从事农业生产。后来，驻防伊犁的满族官兵群众发生生计问题，曾组织过本营的闲散余丁进行农业生产，但由于种种原因，时断时续，成效很不理想。蒙古、索伦等族官兵也曾进行过少量屯田活动，但成效不大。

后一时期即道光时期，主要在平定张格尔、玉素甫之乱以后。在这一时期，天山南北各地迅速增加的人口与耕地不足的矛盾日渐显现出来。为此，在各地官府主持下，新疆掀起了一个垦荒种地的新高潮。清朝也一改过去的民族隔离政策，允许移民迁入南疆的伊拉里克(今托克逊县境内)、喀喇沙尔(今焉耆)、库车、阿克苏、乌什、巴尔楚克、喀什噶尔、叶尔羌、和田等地，进行屯田。据统计，在这一时期，全疆新开垦土地总数在100万亩以上，其中南疆新开垦的土地就占60余万亩。这些新开垦的土地绝大部分给维吾尔、汉、回等各族贫穷的农民耕种，不但解决了他们无地或少地的问题，而且也使官府增加了粮赋收入，进一步促进

了新疆农业生产的发展。

清代新疆屯田的第三阶段在新疆建省前后，即光绪时期。由于战乱和外来侵略势力的破坏，在清军收复新疆时，许多城镇“已同平地”，土地荒芜，“榛莽丛生”，人口大量流亡，不足从前十分之一①。在这种情况下，招集流亡，兴办屯田，自然成了恢复和发展农业生产的主要手段，其主要形式自然是民屯。1887年初，新疆巡抚刘锦棠奏定《新疆屯垦章程》，将民屯事业发展到了一个新的水平。至清末，新疆已经开垦出有水可灌溉的熟田 l100余万亩，人均占有旱涝保收的农田5亩，超过同期全国人均占有耕地面积的一倍。

在谈到历朝历代屯田时，《西域图志．屯政》说：从汉代晁错建议募民徙塞下，已兆屯田之法，至宣帝遣故将吏屯田张掖，而屯政日升。自此以后，“凡有军兴，必修屯政，然而师行则举，师旋则废。议者徒备一时权宜，而未得经久承行之利……汉唐之屯政，专为养兵，而未能兵民并济。汉唐之屯政，专为供战，而未能战守兼宜。”这段议论颇有见地，它既指出了以前各代屯田的局限性，又表明了清代新疆屯田“兵民并济”、“战守兼宜”的特点。清代屯田更注重新疆地区的开发和建设。

清代新疆屯田的形式多样，但主要是民屯。乾隆皇帝曾经指出：国家承平日久，生齿繁庶。“今日户口日增，而各省田土不过如此，不能增益，正宜思所以流通，以养无籍贫民……西陲平定，疆域式廓，辟展、乌鲁木齐等处，在在屯田。而客民之力作、贸易于彼者，日渐加增。将来地利愈开，各省之人，将不招自集。其于惠养生民，甚为有益。”解决内地一些地方人口过剩问题，移民实边，“惠养生民”成了清代新疆屯田的主要目的之一。所以，民屯发展快，规模大，分布广，成为清代新疆屯田的又一显著特点。

清代，通过屯田为重要手段对新疆进行开发和建设，不仅促进了当地社会经济的发展，而且维护了国家的统一，巩固了祖国西北边防。所以道光皇帝说：“是屯田一事，实为安边、便民、足食、足兵之良法。” 这是清代新疆屯田的意义之所在，也是历朝历代新疆屯田的意义之所在。