有关13—14世纪朝鲜半岛倭寇情况的精深研究，主要以韩国和日本学者为主，如李領《倭寇と日麗関係史》（1999）、太田弘毅《倭寇——日本あふれ活動史》（2004）。田中健夫认为，有关“倭寇”的最早记载，见于吉林省集安市的高句丽好太王碑，其中404年条刻有“倭寇溃败”的文字。然而，倭寇真正的持续性活动，应该始于13世纪初期。高宗十年（1223），朝鲜半岛爆发倭寇侵犯事件。五月，“倭寇金州” ，之后几年，倭患事件接连发生。十二年四月，“倭舩二艘寇庆尚道沿海州县，发兵悉擒之”。十三年正月，“倭寇庆尚道沿海州郡”。六月，“倭寇金州”。十四年四月，“倭寇金州，防护别监卢旦发兵，捕贼船二艘，斩三十余级，且献所获兵仗”；五月，“倭寇熊神县”。这一时期的倭寇主要是九州和濑户内海沿岸富于冒险精神的武士、名主和同伙，他们一方面到中国和高丽进行和平贸易，同时也伺机变为海盗掠夺沿岸居民，“对方称此为倭寇（入侵的日本人），大为恐怖”。1265年，因倭寇入侵高丽沿海村庄，高丽政府令将军安洪敏率三别抄军御之。1280年，倭寇再次侵掠固城、漆浦、合浦等地，掳走渔夫。忽必烈两次征日本与倭寇侵犯高丽沿海地区也有一定的关系。为了防范倭寇，高丽曾多次向元朝汇报倭寇侵扰边境的情况，并请求处理。

1350年，倭寇进一步侵犯朝鲜半岛。二月，倭寇侵掠固城、竹枺、巨济等地；四月，倭船百余艘袭击顺天府，掠夺南原、求礼、灵光、长兴等地的官府运粮漕船；五月，倭船60艘袭击顺天府，一艘倭船被捕，13个倭寇被斩杀；六月，倭船20艘烧合浦营舍，袭击固城、会源等地，并进犯长兴府、安壤郡；十一月，倭寇侵犯东莱郡，珍岛县为避免倭寇的侵掠而迁移到内陆。

1370—1380年代，倭寇活动进入了极盛时期。1377年，倭寇至少侵犯朝鲜54次。次年，48次。这一时期，倭寇主要以官方漕粮船和储藏粮食的官库为主要抢劫对象，其规模也比之前要大很多，通常实行团队作战，每个团队可达400艘船、3000余人。